于浩然博士近年来一直从事开发理性设计方法用于酶分子的改造研究，并在此领域做出了国际领先的原创性贡献。具体而言，针对限制酶分子工业化应用的稳定性、活性、立体选择性等性质，创新性地提出了一系列可用于指导酶分子理性设计的思路，并成功应用于转酮酶、荧光素酶、肠激酶、胰蛋白酶、苏氨酸醛缩酶、脂肪酶等多种具有工业应用价值的酶分子改造中。这些研究为酶分子的高效理性设计改造提供了理论依据与实践方法，加深了对蛋白质结构与功能之间关系的认识，推动了生物催化剂在工业实践中的应用。
相关成果以第一作者在PNAS（IF=9.412，2篇），Biotechnology Advances (IF=10.744，1篇),The FEBS Journal (IF=4.392，1篇), Scientific Report (IF=3.998，1篇)等杂志发表学术论文8篇，并作为共同作者在ACS Catalysis (IF=12.35，1篇)、ChemCatChem (IF=4.853，1篇)等杂志发表学术论文6篇。此外，基于相关成果应邀在Elsevier出版的著名电子图书《酶学方法》中撰写章节。总体上，累计发表SCI论文14篇，授权国家发明专利1项，SCI数据库引用240次，他引216次，其中第一作者论文SCI他引共200次。另外，主持浙江大学与伦敦大学学院国际合作项目1项、浙江大学曹光彪高科技发展基金资助项目1项、参与英国工程和物理科学研究委员会（The Engineering and Physical Sciences Research Council）资助的重点项目3项，任英国皇家化学学会准会员（Associate Member）。
