建设高通量自动化科学装置, 为合成生物学研究装上“加速器”

发布者:王杨发布时间:2022-04-08浏览次数:435

微小的细胞可以听从人类“指挥”行使各种功能,合成生物学赋予了它这样的“魔力”。智能存取样本、高通量筛选实验,自动化实验室又为合成生物学研究装上了“加速器”,不仅提高了工作效率,还解放了科学家的双手。

在浙江大学杭州国际科创中心(以下简称科创中心),有这样一位老师,他是最早参与合成生物学自动化科学装置建设的人员之一,现在正带领团队积极摸索装置高效运行的路子,未来希望通过共享平台、定制实验,让科创中心合成生物学自动化科学装置(iBioFoundry)服务更多科研团队、企业,推动产业发展。

他就是科创中心生物与分子智造研究院合成生物学自动化科学装置(iBioFoundry)负责人、科创中心2021年度优秀员工标兵黄磊老师。

 

把简单重复的工作交给机器,让科研人员做更有价值的事情

“我们利用自动化科学装置可以将实验效率提高2个数量级以上,让科研工作者解放双手,花费更多时间去做更有创造力的事。”生物与分子智造研究院合成生物学自动化科学装置(iBioFoundry)俨然已成为科创中心的一个“网红打卡点”,每个来访的嘉宾都会来这里一睹iBioFoundry的“芳容”,一边欣赏高科技的实验设备,一边感叹科技进步神速。

合成生物学自动化科学装置(iBioFoundry)是生物与分子智造研究院的重点建设内容之一。在中央软件控制下,科学装置能够通过轨道式机械臂整合30多种实验设备,实现合成生物学研究中从样本智能存取、DNA元件组装、细胞筛选及培养到产物检测的全流程自动化操作,达到高通量实验的标准化和高效率目标。

黄磊老师全程牵头参与了这套科学装置的建设,从前期实验室规划设计到设备选型,再到采购安装,每一个环节都亲力亲为。为了保证项目进度,黄磊老师和团队的小伙伴们经常加班加点。目前,科学装置已按样本库、细胞筛选及培养、DNA元件组装和分析检测四大功能模块完成基础建设、设备调试。

  

“这套科学装置具备先进的多任务实验进程管理功能,可追踪记录整个流程的处理过程,实现所有的样本追踪溯源,不仅能极大提高实验效率,精确分析实验数据,更重要的是能够解放科研工作者的双手,让他们去做更重要更有创造价值的事情。”


严谨细致的Leader,总能给人带来思考

科创中心这套合成生物学自动化科学装置(iBioFoundry)是目前全球合成生物学研究领域规模最大、集成度最高的一套全流程、高通量、自动化合成生物学科学装置,深度融合了生命科学和信息科学,实现了多学科交叉汇聚,也对工作人员提出了更高要求。

黄磊老师的主要研究领域是微生物转录调控和基因组重排新技术以及合成生物学指导下的基因组进化及其生物产品工程,而科学装置则涉及很多其他领域知识,比如编程。为了更快更好地掌握这套科学装置,黄磊老师不仅自己努力学习吸收其他领域知识,还要求团队的小伙伴们和他一起学习进步。 

他和团队成员一起,从不落下任何一场设备厂家组织的学习培训,还经常组织小组研讨,大家一起交流学习体会,分享学习经验。“黄磊老师总是会发现一些别人没有发现的问题,启发我们做更深入的思考,然后带着我们一起去寻找答案,这是一个非常有意思的过程,我们能从中学到很多东西。”提到黄磊老师,团队小伙伴们一致认为他严谨又细致,认真又温暖。

当前,黄磊老师带领团队成员克服疫情带来的影响,正在紧锣密鼓地准备项目验收,筹备上线运行。未来,黄磊老师希望通过开放共享平台、定制个性化实验,让这套科学装置在在生物制造、医疗健康、农业食品、环境安全等领域实现大规模应用,服务更多的科研团队。